一开始接触生物信息学时，首先接触的就是拟南芥的序列，对这个还是比较有些怀念的。现在每天接触的都是人和老鼠的序列。
NCBI基因组的页面是：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genomes/，这里列出了一些生物的全基因组资源。基本上算是齐全的了。
Arabidopsis thaliana (mouse-ear cress) |
8.1 |
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September 29, 2008 |
拟南芥基因组的更新日期为08/29/2008，现在的版本是8.1，忘记了我刚接触时的版本是多少了。~
NCBI的FTP下载地址：ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/Arabidopsis_thaliana/ （有5条染色体的序列在里面：CHR_I-CHR_V）
The TAIR8 release contains 27,235 protein coding genes, 4759 pseudogenes or transposable elements and 1288 ncRNAs (33,282 genes in all, 38,963 gene models).
如果你要了解更详细的信息，可以进入拟南芥的官方网站：http://www.arabidopsis.org/
FTP下载地址：ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Sequences/whole_chromosomes/
另外，因为下载的这些染色体全序列，单个文件都挺大。一般都要几十M，如果是全基因组放在一起，100M想打开都困难。特别是在Windows下，一大麻烦。想当初我就是为这个愁苦了。当时一个基因组文件300多M，一打开电脑就死机了。
推荐一个软件：EditPlus 汉化版（http://www.crsky.com/soft/1578.html），装好后对着文件点鼠标右键就明白了。打开一些大文件还是挺好用的。当然了，文件在100M以内的话应该都问题不大，取决于你电脑的性能了。如果文件真的太大，在Windows下打开都是比较困难的，这时用Linux就非常不错了。如果你有用linux，还是推荐用这个吧，你可以用more命令来查看。好用，节省你好多时间。
OK，就介绍到这里吧，欢迎一起探讨。有什么问题，欢迎到留言本留言：http://www.liucheng.name/?page_id=135
只要在我能力范围内，尽量为大家解答，为刚学生物信息学的朋友提供一些经验。~：）
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你好，我想依照拟南芥基因在5条染色体上的物理位置信息作一个基因在染色体上的位置图，但是不知道拟南芥的每条染色体长度及着丝点所在的物理位置，你知道在哪个数据库可以查到么？谢谢
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请到yunbio.com，谢谢~
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差距有点大哦
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