图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明


介绍:

This search is similar to the standard protein-protein BLAST with the parameters set automatically to optimize for searching with short sequences.

Find primer binding sites or map short contiguous motifs

说明:

上一篇文章:图文讲解如何用Blast验证引物,应该是比较旧了。Blast界面改版后,现在的链接(Search for short, nearly exact matches)已经不在。没办法,NCBI经常更新的。

我在NCBI搜了一下。在一些教程里好不容易找到了。

网址: Search for short, nearly exact matches

当然了,现在的界面跟以前的也不大一样了。但用法是差不多的。大同小异嘛。

下面再附一下如何从Blast界面进入到Search for short, nearly exact matches

1,进入Blast(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) ,再点上面的Help

图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

2,点击Blast program seletion guide

 图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

3,点击Program Selection Table

图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

4,在Nucleotide一栏找到Search for short, nearly exact matches

图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

 不过,现在用Primer-Blast是不一个不错的选择。教程有空翻译一下。


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