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NCBI新的数据库和工具(NCBI News, June 2009)

Posted on 22 六月 2009 by 柳城 ,阅读 396

BioSystems

BioSystems是NCBI新的数据库,收集合作的公共数据库中所有生物系统的数据。BioSystems是一个集中的生物系统知识库,联合Entrez系统的文献,分子,和化学等的数据。

目前的BioSystems包含有来自KEGG和BioCyc的生物信号通路,未来将会容纳更多其它类型的生物系统数据库。生物系统的明细图和注释在来源的数据库网站可以找到。在NCBI的Gene, HomoloGene, OMIM, 和 Protein Clusters 数据库的记录将会有链接到BioSystems。详情更登陆BioSystems的主页:www.ncbi.nlm.nih.gov/biosystems/

Genome Resources

NCBI基因组资源页面提供了一个综合的指导,如何为一个特定的生物链接到NCBI的资源。现在Genome Resources新增加了豆长管蚜(Pea Aphid, Acyrthosiphon pisum)和山羊(goat, Capra hircus)。请情请查看:www.ncbi.nlm.nih.gov/Genomes/

Microbial Genomes

4月30号-5月28,又有21个完成测序的微生物基因组发布了。这些数据同时在GenBank/EMBL/DDBJ都可找到:ftp.ncbi.nih.gov/genbank/genomes/Bacteria/

更新和改进

RefSeq

09-05-04,参考序列(RefSeq)发布了第35个版本。全纪录包括基因组序列、转录序列、和蛋白序列,来自于8,393个物种和菌株,包括10,993,891个记录。RefSeq的主页:www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/。FTP:ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release

NCBI News, June 2009

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