在NCBI最新版的Blast可以通过FTP下载。目前的最新版本是2.2.20
下面的wwwblast所指的是已经构建好的基于web页面的blast。windows下的版本还没有。
platform blast netblast wwwblast
win32-ia32 download download n/a
win64-x64 download download n/a
Linux-ia32 download download download
linux-x64 download download download
macosx-universal download download download
solaris-sparc64 download download download
solaris-x64 download download download
如果上面的下载地址失效了。这可能是Blast的版本更新了。你可以直接通过登陆到NCBI的FTP直接下载。通过迅雷和快车等工具也是可以的。
ftp ftp.ncbi.nlm.nih.gov
cd /blast/executables/LATEST
ftp /blast/executables/LATEST > ls blast-2.2.20-ia32-freebsd.tar.gz netblast-2.2.20-ia32-win32.exe blast-2.2.20-ia32-linux.tar.gz netblast-2.2.20-ia64-linux.tar.gz blast-2.2.20-ia32-solaris.tar.gz netblast-2.2.20-sparc64-solaris.tar.gz blast-2.2.20-ia32-win32.exe netblast-2.2.20-universal-macosx.tar.gz blast-2.2.20-ia64-linux.tar.gz netblast-2.2.20-x64-linux.tar.gz blast-2.2.20-sparc64-solaris.tar.gz netblast-2.2.20-x64-solaris.tar.gz blast-2.2.20-universal-macosx.tar.gz netblast-2.2.20-x64-win64.exe blast-2.2.20-x64-linux.tar.gz wwwblast-2.2.20-ia32-freebsd.tar.gz blast-2.2.20-x64-solaris.tar.gz wwwblast-2.2.20-ia32-linux.tar.gz blast-2.2.20-x64-win64.exe wwwblast-2.2.20-ia32-solaris.tar.gz ncbi.tar.gz wwwblast-2.2.20-ia64-linux.tar.gz ncbiz.exe wwwblast-2.2.20-sparc64-solaris.tar.gz netblast-2.2.20-ia32-freebsd.tar.gz wwwblast-2.2.20-universal-macosx.tar.gz netblast-2.2.20-ia32-linux.tar.gz wwwblast-2.2.20-x64-linux.tar.gz netblast-2.2.20-ia32-solaris.tar.gz wwwblast-2.2.20-x64-solaris.tar.gz
非常方便。你可用于构建本地的Blast,也可用于构建web页面的Blast。
关于Blast的详细文档,看这里:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/docs/
3条回应:“最新版的blast下载”
您好,NCBI上的单机Blast数据库有N多文件,都要全部下下来么?而且都是压缩包,直接放在安装目录就行么?NCBI上我没找到相关的说明,谢谢!
是不同版本,不同系统的(win,linux等)
可到yunbio.com提问吧
[…] 准备1:Linux,下载Blast。看最新版的blast下载,找到适合你的版本。假设安装在/usr/NCBI/blast/ […]