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用Perl抓取网页和提交表格

Posted on 25 二月 2010 by 柳城 ,阅读 48 简洁版

这里简单介绍一下用Perl来实现抓好取网页的源代码,以及用POST的方法来提交表格,并返回结果。难的讲不来,讲讲简单的。

这里讲到的Perl模块有:

use LWP::Simple;
use LWP::UserAgent;

perldoc查看详细的用法。 Continue Reading

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Perl split函数

Posted on 30 一月 2010 by 柳城 ,阅读 150 简洁版

学习Perl语言编程中……

介绍:

split /PATTERN/, EXPR
split /PATTERN/
split

Perl split函数扫描字符串中EXPR给出的分隔符,并把该字符串劈成一个子字符串列表。简单地意思就是把字符串,按照/PATTERN/里的分隔符来分隔,返回一个数组。/PATTERN/可以是分隔符(逗号空格等),也可以是正则表达式。 Continue Reading

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Perl处理Fasta序列的又一实例

Posted on 13 一月 2010 by 柳城 ,阅读 204 简洁版

今天再来分享一小段Perl脚本,其实是比较简单的。主要是用来处理Fasta格式的序列

网友niche Says:

你好,你有没有分割fasta文件的perl脚本,我需要把一个fasta文件按两条序列一组分成若干个fasta文件,谢谢!

如果不懂fasta文件,可以再看一下解释Continue Reading

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快速提取序列的Perl脚本

Posted on 04 一月 2010 by 柳城 ,阅读 237 简洁版

是这么回事的,整理一下一些有用的提问。感谢大家的提问。

网友sun:

我从miRbase数据库下载到了,matrue.fa,即里面有测出来的物种的成熟miRNA,里面有human 我想用perl把human的提出来另外存到一个文件.这是其中人的一条的
>hsa-miR-96 MIMAT0000095 Homo sapiens miR-96
UUUGGCACUAGCACAUUUUUGCU
怎么把所有的都提出来.
ps:正则表达式不是这个$s=~/^>hsa/期待你的回信.

Continue Reading

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Perl closedir函数

Posted on 23 十二月 2009 by 柳城 ,阅读 64 简洁版

学习Perl语言编程中……

介绍:

Perl closedir函数关闭opendir打开的一个目录,如果关闭成功则返回真,否则返回假。参阅readdir里的例子。FILEHANDLE可以是一个表达式,它的值可以用做一个间接目录句柄,通常是真实目录句柄的名字。 Continue Reading

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Perl close函数

Posted on 15 十二月 2009 by 柳城 ,阅读 67 简洁版

学习Perl语言编程中……

介绍:

close函数关闭与FILEHANDLE相关联的文件、套接字或者管道。(如果省略参数,那么它关闭当前选定的文件句柄。)如果关闭成功则返回真,否则返回假。

如果你准备马上就对FILEHANDLE做另外一次open,那么你用不着关闭它,因为下一次open会替你关闭它(参阅open)。不过,对输入文件的明确关闭将重置行计数器($.),而open做的隐式关闭不会做这件事情。 Continue Reading

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两种方法查看文件的行数

Posted on 04 十二月 2009 by 柳城 ,阅读 256 简洁版

对于我们所操作的文件或是数据,行数是一个最常用的值。最后的统计结果当中,这个行数也是差不多作为一个必需项出现的,因为行数在大部分情况下,就是代表着总数。

我每天工作都是在接触两种系统:XP和Linux。所以介绍两种我常用的计算行数的方法,Excel的方法及linux命令的方法Continue Reading

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Perl chr函数

Posted on 26 十一月 2009 by 柳城 ,阅读 123 简洁版

Perl chr函数

学习Perl语言编程中……,打算边学边把Perl函数整理出来。

介绍:

chr函数返回NUMBER在字符集中代表的字符。比如,chr(65)在ASCII或Unicode中都是“A”,而chr(0x263a)是一个Unicode的笑脸。

如果想使用chr函数的反向功能,可使用ordContinue Reading

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