Bioinformatics,生物信息学

如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列

图解:如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列

事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天先介绍着一种,以后有必要再介绍其它的。通过Blast是一种办法,但不够直观,需要判断的条件要多一些,经验也需要多一些。如果条件允许的话,我们可以借助其它一些专门的软件,让事情变得容易。 阅读更多

知道一个酶的英文怎么在NCBI上查找找基因_3

图文讲解:知道一个酶的英文怎么在NCBI上查找基因?

NCBI上查找基因,挺多人都在问这个。当然,对于经常泡NCBI的人来说,查找基因是入门的、基础的,对高手来讲根本不是个问题。但新手就不同了,想当初我第一次接触NCBI时,也是一头雾水,特别是我的英文实在不咋样好。 阅读更多

dnaman

LIUCHENG.NAME教程:如何把clusterX的结果转为漂亮的图片

序列比对在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,Clustal W(Dos版本)很适合这些方面的要求,Clustal X是window版本。 阅读更多

用RSS订阅NCBI-PubMed文献

用RSS订阅NCBI-PubMed文献

  文献跟踪是少不了的,无论是某检索式的跟踪、某篇文章引文的跟踪,还是某个主题的跟踪等等。以往进行文献跟踪大多为邮件订阅,然而,利用RSS订阅会更加及时方便。
         RSS需要有阅读器才能使用,这样的阅读器很多,有在线阅读器(打开一个网址就可以),离线阅读器(安装软件),还有些浏览器中也有RSS阅读器的插件,目前来看,在线阅读器还是更好一些,我这里推荐google reader. 阅读更多

关于RefSeq:NCBI参考序列

关于RefSeq:NCBI参考序列
NCBI的参考序列计划(RefSeq)将为中心法则中自然存在的分子,从染色体到mRNA到蛋白提供参考序列标准。RefSeq标准为人类基因组的功能注解提供一个基础。它们为突变分析,基因表达研究,和多态发现提供一个稳定的参考点。 阅读更多

NCBI–LocusLink介绍

位点链接(LocusLink)提供一个单一查询界面来找到某一个遗传位点的序列和描述性信息。它展现官方命名,别名,序列登录,表型,EC号码,MIM号码,UniGene聚类,同源,图谱位点,和相关的网站信息。 阅读更多

什么是GOE

Gene Expression Omnibus (GEO)介绍

为了支持公共使用和散布基因表达数据,NCBI开始了基因表达汇编(GEO)计划。GEO是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。来自于microarray,高密度寡核苷酸array(HAD),杂交膜(filter)和SAGE的许多类型的基因表达数据都被接受,登记,和存档,作为一个公共数据集合。一系列预先计算的数据的定义和描述,以及用于交互检索和分析这些表达数据的在线工具即将放入。 阅读更多