Bioinformatics,生物信息学

Cluster of Orthologous Groups of proteins(COG)介绍

什么是COG?
“COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins(蛋白相邻类的聚簇)的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白,并且因此或者是orthologs或者是paralogs。Orthologs是指来自于不同物种的由垂直家系(物种形成)进化而来的蛋白,并且典型的保留与原始蛋白有相同的功能。Paralogs是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白,可能会进化出新的与原来有关的功能。请参考文献获得更多的信息。 阅读更多

UniGene Resources

The UniGene System UniGene是从属于GeneBank的一部分,专门收集非冗余性的基因来源的clusters数据。每一个UniGene Cluster包含代表单一基因的序列和相关的信息,例如基因表达的组织类型和图谱定位信息。 阅读更多

NCBI-基因和疾病

理解遗传学因子是如何对人类疾病起作用的探索进展的非常迅速。五十年以前,DNA的结构才被解除,关于人类到到底有多少条染色体还争论不休。21号染色体三体和唐氏综合症的联系就处于发现的前夜,当时发展水平的计算机是一台30吨重,占地1000平方英尺的。 阅读更多

NCBI-Coffee Break

随着在分子生物学和信息技术科学的成功,出现了一个崭新的迅速发展的领域:生物信息学——数据收集,组织和计算分析的加工程序。生物信息学是一个生物的理论研究,使用计算机算法和已知的只是来从大量可获得的分子数据中发掘金子般有用的信息来。这些研究可以提供科学研究者新的解决生物医药问题的方向——现在很少有研究不会利用在线的数据分析,从文献检索到DNA序列搜索到3D分子模型。 阅读更多

NCBI站点地图—其他各项介绍

NCBI的研究的概览

计算生物学分支主页 — 在NCBI计算生物学分支研究计划的概览和高级研究员的列表。研究项目集中在对广泛的分子生物学基本问题的理论的,分析的,和应用的解决方法,包括生物分子结构,基因组分析,序列分析理论,硬件设计,软件和数据库设计,和文本检索和文件分析。 阅读更多

NCBI站点地图—其他基因组数据介绍

小鼠基因组

小鼠基因组资源向导 — 把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。

小鼠基因组测序 — 小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由测序中心的数据建立,可以contig或染色体的形式来下载。 阅读更多

NCBI站点地图—Human Genome人类基因组数据介绍

向导

人类基因组资源向导 — 可用的人类基因组数据资源概览。包括关于人类基因组的公告和进展报告和提供对以前分离的数据的集中访问。

人类基因组序列数据的状态 — 描述了目前在GenBank中的数据的范围,包括完成的和草图高通量基因组序列数据的讨论。 阅读更多

NCBI站点地图—关于Database的一般介绍

GenBank Overview

基本信息

什么是GenBank?GenBank是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。 阅读更多