Bioinformatics,生物信息学

NCBI(美国国立生物技术信息中心)简介

NCBI(美国国立生物技术信息中心)简介

理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,出现了生命过程的语法,其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性,并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具,以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。 阅读更多

生物信息学:努力在数据的海洋里畅游

Bioinformatics–Trying to Swim in a Sea of Data

    我们处在一个激动人心的时代——基因组时代。科学的进步已使人类可以窥探生命的秘密,甚至包括人类自身。人类基因组在世纪之交被人类自己破译了。 阅读更多

本地blast下载

Overview

The blast archives contain utilities that allow you to run searches on your own computer. The netblast archives contain a command-line network client that allows you to submit searches to NCBI. The wwwblast archives contain an example of a blast web server. Known bugs/workarounds may be found on the errata page. 阅读更多

本地blast的详细用法

本地blast的详细使用方法

blastall -p blastn -i myRNA.fasta -d humanRNA.fasta -o myresult.blastout -a 2 -F F -T T -e 1e-10
解释如下:

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