PHP柱形统计图

<?php
/*
* ◎功能:柱形统计图
* ◎参数:$statName 统计图的名称
*        $labelAry 统计项目标签数组
*        $dataAry  统计项目数据数组
*        $direct   统计图中柱形的方向,H为横向,V为纵向
* ◎返回:HTML代码
* ◎By Longware
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Bioperl:使用和解析 BLAST

转自:Perlchina.org

使用和解析 BLAST
生物信息学中最流行的数据库搜索程序就是 BLAST 了,和前面获取序列数据的原则一样,也有两种方法可以让你使用BLAST:在 NCBI 等站点上运行它并得到返回结果,或者下载到本地运行。 阅读更多

Bioperl:对序列数据进行操作

转自Perlchina.org

分子生物学数据库(如GeneBank,DDBJ, EMBL,SwissProt,PIR等)包含许多种格式的序列数据,有简单的格式也有复杂的格式。简单的格式如FASTA,GCG,只包含名字和序列,复杂的格式如GeneBank, EMBL格式,包含序列,参考文献,注释等等许多信息。 阅读更多

Bioperl:获取序列数据

转自:PerlChina.org

有两种方法: 1, 使用 Bio::DB::GenBank (使用Web Interface获取序列数据,当需要获取大量数据的时候不建议使用,否则 ip 有可能被 ban) 2, 下载整个 NCBI 数据库到本地,使用 Bio::DB::Flat 对它建立 index。 阅读更多

提问的智慧

提问的智慧

当提出一个问题时,你能得到怎样的回答?这取决于挖出答案的难度,同样取决于你提问的方法。本指南旨在帮助你提高发问技巧,以获取你最想要的答案。 阅读更多

静夜思

【弦动我心】静夜思

    (NJ:蚂蚁)大家好,欢迎各位收听中国国际广播电台,国际在线——在线广播为您每周4带来的音乐杂志——弦动我心。希望您喜欢今天的节目,我是蚂蚁。夜晚是黑色的,也是多彩的的;是宁静的,也是躁动的;是孤独的,也是热闹的。所以它在我们心里是彩色的。在夜里你喜欢那一种颜色呢? 阅读更多

clustalx-20-screenshot-on-mac-os-x

ClustalW、ClustalX介绍及最新版下载地址

         Clustal的基本思想是基于相似序列通常具有进化相关性这一假设。比对过程中,先对所有的序列进行两两比对并计算它们的相似性分数值,然后根据相似性分数值将它们分成若干组,并在每组之间进行比对,计算相似性分数值。 阅读更多