COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对(比ClustalW还强大的工具)

COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对(比ClustalW还强大的工具)

COBALT is a multiple sequence alignment tool that finds a collection of pairwise constraints derived from conserved domain database, protein motif database, and sequence similarity, using RPS-BLAST, BLASTP, and PHI-BLAST.
Pairwise constraints are then incorporated into a progressive multiple alignment.

COBALT是一个蛋白的多序列比对工具,其实用法跟ClustalW是很像的。算法应该是不一样的。在我看来,COBALT是应该更加精确的。因为COBALT在多序列比对的同时,也用到RPS-BLAST, BLASTP, 和PHI-BLAST等工具,并且也用到了conserved domain database (CDD) 和PROSITE protein-motif database来保证COBALT比对结果的质量。最后比对的结果可以生成系统进化树。COBALT算是NCBI在线Blast功能的一个的延伸。 阅读更多

精选资料:2009 H1N1流感病毒序列

精选资料:2009 H1N1流感病毒序列

柳城博客:本文翻译自NCBI News, May 2009)2009年全球H1N1流感突然爆发,NCBI作为流感病毒序列的储存库,一直为加快序列的发布作出最大的努力。现在,你可以取到最新的H1N1流感病毒的序列,并且在一个专门为H1N1流感病毒设计的页面中找到最新的信息。 阅读更多