alexa

记录一下,ALEXA排名已经突破一百万

纯粹纪录。ALEXA排名

不知不觉跨过了一百万的大关。可能是上个月。今天查询一下,目前的排名是:

综合排名: 814,913

alexa

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  Alexa(www.alexa.com)是一家专门发布网站世界排名的网站。以搜索引擎起家的Alexa创建于1996年4月(美国),目的是让互联网网友在分享虚拟世界资源的同时,更多地参与互联网资源的组织。Alexa每天在网上搜集超过1,000GB的信息,不仅给出多达几十亿的网址链接,而且为其中的每一个网站进行了排名。可以说,Alexa是当前拥有URL数量最庞大,排名信息发布最详尽的网站。

Plot of NP_004170

NCBI工具:BLAST 2 Sequences的用法

BLAST 2 Sequences,在很早前NCBI就有提供这种工具的了。最近在2008年底又重新改版了,改版后的功能更加强大。有许多非常实用,但你可能不是太清楚的功能。这里大概提一下,具体的详细用法,还是要靠你自己慢慢摸索。

功能介绍:

  • 1,两个序列之间的比对(BLAST 2 Sequences),这是最初的功能
  • 2,BLAST 多个序列。
  • 3,BLAST 2 Sequences时,还能用点矩阵图(Dot Matrix)查看
  • 4,BLAST 多个序列时,还能进一步做进化树分析。

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插件发布:WP keyword Link Plugin(Wordprss内链外链插件)

插件发布:WP keyword Link Plugin(WordPress内链外链插件)

本插件已经取得原作者的允许,即将作为一个新的插件将WordPrss官方发布上传。高兴,感谢原作者martin。此插件是在原有的基础上加入加中文关键词的链接。主要面向所有的中文wordpress用户。

插件发布

Plugin Name » WP Keyword Link 阅读更多

构建Web页面的Blast(windows/linux)

准备1:Linux,下载blast。看最新版的blast下载,找到适合你的版本。假设安装在/usr/ncbi/blast/

准备2:php环境,运行一个例子看看。如果一切胜利。正常情况下,一般需要在你用户名(如zhenglc)下建个文件夹public_html,里面随便放个页面。内容可以是: 阅读更多

用Perl下载NCBI的Blast库(Blastdb)

有时你要构建本地的Blast,需要用到NCBI已经构建好的Blastdb。可以用FTP下载。这里NCBI还提供一个Perl程序来下载NCBI的blast库。

update_blastdb.pl – Download pre-formatted BLAST databases from NCBI。右键另存为 阅读更多

最新版的blast下载

在NCBI最新版的Blast可以通过FTP下载。目前的最新版本是2.2.20

 下面的wwwblast所指的是已经构建好的基于web页面的blast。windows下的版本还没有。

platform    blast      netblast     wwwblast 阅读更多

【弦动我心】心中的小王子

【弦动我心】心中的小王子

 注:这期的电台我很喜欢。听了有几十遍了。特别推荐。
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(NJ:蚂蚁 大家好,这里是中国国际广播电台,国际在线在线广播。欢迎来到弦动我心,我是蚂蚁。两年前以前,在大学里知道了小王子,第一次读小王子已经记不得具体的细节了,笔法是淡淡,总有大块的留白。风,星辰,玫瑰,小铃铛,散漫的回忆,清凉的水,感觉起来就像蓝色的墨水和彩色铅笔的图画,字里行间都仿佛含着一个轻轻的笑;甚至连沙漠也不再有对生命的威胁,只是成了隔绝凡尘与这个童话般梦境的一座城堡。

2年后,我在一家小店看到了这本书,看到了圣埃克苏佩里手绘的小王子形象,那是人民文学出版社童话系列丛书的一本,只卖五块钱。那一天,我真正认识了不快乐的小王子,知道了他和圣埃克苏佩里的故事,知道了日常生活中我们忽略了的灵性存在。我没读过这么忧伤的童话,它击碎了成人世界的雾障,透露出细细碎碎的关于自由和灵魂的隐秘气息。 阅读更多

NCBI查找基因序列实例分析-羊GAPDH基因

之前也发过几篇关于在NCBI查找序列的,你可以在本博客里搜索一下。这方面问的人比较多。通过一些实例的分析,帮助大家更好的理解。

这里再讲解一下查找GAPDH基因的例子。

1,进入NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

2,选择Gene数据库(注,Gene数据库收录的基因序列相对较少。你也可以选择Nucleotide数据库,用相同的关键词搜索一下试试看)。 阅读更多