两个在线基因预测工具Glimmer和ORF Finder比较

ORF FinderGlimmer两个都是基因预测的NCBI在线工具:

ORF Finder的主页是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/

Glimmer在线的主页是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/glimmer_3.cgi

关于ORF Finder的详细介绍看:ORF Finder使用说明及基因预测
关于Glimmer的详细介绍看: 微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer 阅读更多

故事改编自安徒生一生中所写的最后一篇童话

弦动我心 童话·《老约翰妮讲了些什么》

弦动我心时间。今天来听故事……静静的。

弦动我心 童话·且听风吟

 (NJ:蚂蚁大家好,这里是弦动我心,我是蚂蚁。今天要给大家讲一个童话故事,故事改编自安徒生一生中所写的最后一篇童话《老约翰妮讲了些什么》。这个童话其实充满了现实的苦涩,是个悲剧的故事。故事告诉了我们如果一个人没有信念那将是一件多么可怕的事情。下面,我们就一起来听这个故事吧…… 阅读更多

Glimmer的在线运行

微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer

Glimmer简介

Glimmer用于微生物DNA的基因预测,特别是细菌、古细菌、和病毒等的基因组。Glimmer(Gene Locator and Interpolated Markov ModelER)采用内插马尔可夫模型(interpolated Markov models,IMMs)来识别编码区域和从非编码的DNA中区分出来。 阅读更多

Perl abs函数

PHP已经学习得七七八八了。接下来要有大的进展,就是要从实践中学习了。那现在要转战Perl咯,开始学习Perl的函数。

每日一函数:Perl abs函数

介绍

abs函数返回它的参数(VALUE)的绝对值。当没有指定参数时,返回$_的绝对值。 阅读更多

让博客的RSS分类输出(置顶)

 今天要来调整一个博客的RSS输出。大体上分为两类,让不同的同户订阅不同的RSS地址。一类主要是生物信息学的,一类是排除了生物信息学之外的。 阅读更多

我们都在起跑点-呐喊

老照片之投稿篇(2):学生田径运动会

依然还是老照片,依然还是投稿篇。这是海洋大学举行第六届学生田径运动会上的拍的几张照片,当然是不只这几张,不过投稿后,编辑最终选用的是这几张。

时间:摄于2005-12-09

地点:广东海洋大学,运动场

相机:佳能A85(为了显示快一点,照片都经过压缩处理。未能达到最佳显示效果,抱歉!)

说明:恩,也不用问了。没有PS过。那为什么背景会模糊?给你说一些拍摄技巧,相机跟着在跑步的人动,在移动的过程中(保持相机稳)按下快门,就可以达到主体清晰,背景模糊的效果了。多练练。 阅读更多

结束语 人类基因组 我们的DNA 专题已整理完毕

人类基因组 我们的DNA 专题 大致上从8月17号开始整理,到今天刚好历经一个月的时间。中间偷懒了一段时间,今天一次性补回来。

终于都到了结尾篇,这个结尾嘛,只是我认为的结尾而已。书中的内容还是有很多的,只是好多比较难懂的我都没有摘录过来。

最近事情儿也比较多,只好匆匆结尾。现整理一下目录。

人类基因组 我们的DNA 专题 目录 阅读更多

新闻媒体报道的人类基因组

7 人类基因组 我们的DNA 专题之七, 也是本专题的结尾了。

2001年2月发表的研究论文得到了新闻媒体更多的关注。下面选自已经见报的一些报道。

用新闻术语描述基因组测序不是一个简单的事情

 

《波士顿环球》: 阅读更多