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用关键词sesame,数据库选Taxonomy

如何批量下载某物种的EST序列

直接切入正题吧。这篇文章是讲解批量下载某物种的EST序列数据。大体上的思路有几种方法:

  1. 用NCBI的Entrez搜索下载
  2. 用NCBI的FTP下载
  3. 其它二级数据库,专门提供的EST序列下载

这里重要介绍用NCBI的Entrez搜索来下载EST序列。NCBI的FTP嘛,找了半天也没有找到单个物种的EST序列,打包在一起的才有。第三种办法嘛简单提一下PlantGDB网站,植物方面的基因组序列和EST序列比较齐全。

锁定物种:芝麻sesame,Sesamum indicum) 阅读更多