Blast (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。

　　BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。如果您想进一步了解BLAST算法，您可以参考NCBI的BLAST Course ，该页有BLAST算法的介绍。 Continue Reading

Blast一种是在线的(http://blast.NCBI.nlm.nih.gov/Blast.cgi)，一种是本地的(Local BLAST，单机版BLAST，Standalone BLAST)。
对于少量的序列，如果要在跟整个（或者某一物种）核酸或者蛋白库比对，一般采用在线BLAST，简单易用，直观，容易被人接受其；对于大量序列，或者是目前不方便公开的数据库，或者是自定义的数据库，一般采用本地BLAST，其效率高，能满足用户更多的要求，但操作相对有点繁琐； Continue Reading