蛋白质功能预测

  一、根据序列预测功能的一般过程

 如果序列重叠群(contig)包含有蛋白质编码区，则接下来的分析任务是确定表达产物--蛋白质的功能。蛋白质的许多特性可直接从序列上分析获得，如疏水性，它可以用于预测序列是否跨膜螺旋(transmenbrane helix)或是前导序列(leader sequence)。但是，总的来说，我们根据序列预测蛋白质功能的唯一方法是通过数据库搜寻，比较该蛋白是否与已知功能的蛋白质相似。有2条主要途径可以进行上述的比较分析： Continue Reading