进化树∷柳城

Tag Archive | "进化树"

生物信息学作业(二)：核酸及蛋白质序列的比对

Tags: 核酸序列, 蛋白序列, 进化树

生物信息学作业(二)：核酸及蛋白质序列的比对

Posted on 06 七月 2009 by 柳城，阅读 536

一、实验内容

利用检索出的蛋白质和核酸序列进行序列比对并进行分子进化树分析。

二、作业

1、绘制分子进化树，并标明各个物种phyA蛋白之间的序列相似性。 Continue Reading

一篇文献,构建进化树的入门分析

Tags: 入门分析, 文献, 进化树

一篇文献,构建进化树的入门分析

Posted on 30 六月 2009 by 柳城，阅读 616

从简单的进化理论，到什么是进化树，怎么才会用到进化树，到如何获得好的有意义的进化树。短短几页讲述的很明白，句句简单，句句深厚。
Phylogeny　for　the　faint　of　heart　a　tutorial.　2003.TRENDS in Genetics

http://www.cs.queensu.ca/home/cisc875/faint.pdf

不过是英文的。不知有没有牛人大概翻译一下拿出来共享呢~ Continue Reading

Tags: ClustalX, phylip, 序列比对, 生物信息软件, 进化树

phylip软件包建进化树

Posted on 19 五月 2009 by 柳城，阅读 1,001

1. 打开ClustalX软件（对序列进行比对），点击“文件”→“载入序列”；点击“比对” →“输出格式选项” →“phylip格式”前打勾；点击“比对” →“完全比对”；比对完成后，关闭程序，并将生成的带.phy后缀的文件拷贝至phylip软件包的“exe”文件夹下。 Continue Reading

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