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如何在NCBI实现大批量数据的一一对应

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如何在NCBI实现大批量数据的一一对应

Posted on 07 七月 2009 by 柳城 ,阅读 1,408

有时我们手头会有一批数据,或者是只有大量的某些id。比方说:accession number、gi、geneid、symbol、gounigene、pubmed、taxid等等。事实大部分数据库都会有提供一些专门的文件或工具来实现这些数据间大批量的一一对应。

先来讲讲NCBI的。

用FTP登陆ftp.ncbi.nih.gov(windows下可以直接打开或是用迅雷/Flastget等下载工具)。cd gene/DATA(windows下依次找到gene/DATA这个文件夹)。ls一下,里面的文件大概有: Continue Reading

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知道基因名(Symbol)怎样查找基因的序列?

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知道基因名(Symbol)怎样查找基因的序列?

Posted on 23 四月 2009 by 柳城 ,阅读 3,621

上一次讲解了知道一个酶的英文怎样在NCBI上查找基因?,今天再来讲解另外一种情况,知道了基因名(即Symbol),怎样在NCBI上查找该基因的序列Continue Reading

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