如何向NCBI提交序列？
向NCBI提交序列常用的程序有两个，一个是在线提交的BankIt，一个是用软件Sequin。用那种办法，根据不同的需要。
BankIt:(在线提交页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/index.html)
- 适合单个或少量几个的提交
- 喜欢用在线的方式提交，无需下载个软件
- 你的序列的注释不复杂
- 提交你的序列时不需要用到序列的分析
Sequin（下载页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html）
- 提交的是批量而且比较复杂的序列
- you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets
- 喜欢图形的界面，有更的选项和功能，可以批量修改
- 获得相关的分析工具
这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt，Sequin也是大同小异的。
1，过入GenBank
2，左栏点击Submit to GenBank
3，左边出现几个工具的选择，点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面，填上你要提交的序列的长度，点New
4，点New后，会生成一个bankit号，记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊，序列之类的
5，填好资料后，你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误，点提交（Validate and continue）
6，如果你填的资料有误，或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字，电话，Email，序列等都是必须的。
最后NCBI会给您发个邮件，等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了，如果有问题NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequin，填好资料过程中可以随时保存，最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。
差不多就是这样，其它细节问题。自己琢磨琢磨去。
有点相关的文章
- 用Sequin向NCBI提交序列 (1.000)
- Notice: NCBI系统维护 (0.629)
- 图解：如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列 (0.514)
- NCBI Entrez Programming Utilities (E-utilities) 教程收藏 (0.514)
- GenBank序列修订版历史查询工具 (0.514)
- NCBI－Coffee Break (RANDOM - 0.507)
柳城博客：
您好！
我现在正在做测序实验，想把序列提交到NCBI，但是网上的信息不知道怎么填。其中有一个First citation associated with sequence:
Note! Please provide a title regardless of publication status.
中文意思是不是即使还没发表文章，也要写上一篇引用的文章题目？这里的引用的文章题目指的是什么？您能不能帮我解答一下？谢谢！
还有一个问题：
Source Modifiers和Primer Information后面都有一个Value,这个Value是评估什么？应该怎样填？
请您帮我解答一下，谢谢！
噢噢..现在才看到你这个问题..真是不好意思!! [尴尬]
柳城博客：
您好！
我现在正在做测序实验，我把我的ITS输入NCBI做BLAST得到很多序列，比对结果碱基序列长度不一样。我选取了其中几个排名个靠前的序列用clustalX比对后，再用MEGA做进化树，结果发现我的序列跟其他的任何一只序列都不在一只分支上，单独成一只孤独的树枝，然后我就用Genedoc对这几个序列进行比对，发现我的序列跟其他的序列同源性很底，但是做BLAST的时候MAX indent 能够达到99%.请问这是为什么，如何再来做我的进化树！
谢谢了
blast结果只看MAX indent是严重不够的,比方你的序列有1000bp, 但只有100bp完全匹配,那MAX indent的值也是100%啊. 重要的是E值,越小越好.
另外你做blast要多做几个blast库.仅靠一次blast,一个blast库,是不够的.
柳城博主：
您好！收到您的回复万分高兴，同时也有些新的问题向您请教。您回复中提到“做blast要多做几个blast库.仅靠一次blast,一个blast库,是不够的.”具体是何意思，应该怎么做麻烦具体告知为感。
我现在正在做利用分子方法进行微生物菌种鉴定实验，我把我的ITS输入NCBI做BLAST得到很多序列，比对结果碱基序列长度不一样。我选取了其中几个排名个靠前的序列用clustalX比对后，再用MEGA4.1软件，NJ法构建的进化树，现在把系统进化树结果发给您看看帮我分析下构建的树是否正常。请给予帮助，万分感谢！邮件发到你的zhengchengliu@gmail.com
ERROR: The Middle Initials require periods after each initial if more then one is entered.
在线提交序列时，出现以上错误提示，为什么，请问如何解决
很不错，谢谢！这是老版本的submit吧
你好！
怎样查找自己或其他人提交的所有序列啊？最近找了很多方法，都不行。谢谢了
柳城博主：
您好，我现在刚刚接触这一块，原来师兄在NCBI上面上传了一个基因的部分片段，现在我需要把剩余的补充完整，但是我不是很清楚如何在上面更新基因序列，是重新申请登录号，还是在其基础上更新…..希望给予帮助，万分感谢！！！