郝伯林院士的生物信息学讲义

郝伯林院士的生物信息学讲座讲义 20M,为ppt和pdf格式。不错的讲义~

Lecture Notes:

1. Bioinformatics from an interdisciplinary point of view (in Chinese)

2. General introduction and plan of lectures PDF.

3. Introduction to statistics and statistical physics PDF.

4. Signal models. Dynamic programming. Sequence alignment PDF.

5. Finding genes in the rice genome PPT.

6. Prokaryote phylogeny without sequence alignment PPT.

7. Grammatical complexity of symbolic sequences (mixed English and Chinese) PPT.

8. The 7 bridges in Konigberg and composition representation of protein sequences PPT.

9. Visualization of K-tuples in DNA and their randomized counterparts PPT.

10. Physico-mathematical sciences and life science PPT (in Chinese).

Homework PDF.

http://power.itp.ac.cn/%7Ehao/lectures.htm

9 回复
  1. fenger says:

    请问柳城大侠,

    我想在NCBI上得到酵母菌的酶切图谱,如何能够得到?

    我觉得您肯定能知道,因为,您是生物强人

    zhenglc 回复:

    @fenger,

    不敢当。明天我找找,现在也没办法给你。找到再告诉你哦。

  2. fenger says:

    柳城大侠,

    我跟您学了一手查找酶切位点的方法。

    但是,我想找酵母全基因组的酶切位点,而且我想找出其中六个碱基的酶,想知道哪个酶的酶切位点在酵母基因组中出现的频率最高。以期用相应的酶来切我的基因组。

    我已经查到了酵母菌的16条染色体的物理图谱,我觉得只要统计一下其中哪个酶出现的最多就可以了,不难。我认为应当有。

    但是我自己查不到。只好再一次问大侠您

    zhenglc 回复:

    @fenger,

    有了序列就方便了嘛。方法都是那样啦。不过要统计这种比较复杂的情况。DnaMan就没办法了。可以试一下EMBOSS 软件包。里面有个程序,是做酶切分析的。可以很快的统计出来。

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