图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明
介绍:
This search is similar to the standard protein-protein BLAST with the parameters set automatically to optimize for searching with short sequences.
Find primer binding sites or map short contiguous motifs
说明:
上一篇文章:图文讲解如何用Blast验证引物,应该是比较旧了。Blast界面改版后,现在的链接(Search for short, nearly exact matches)已经不在。没办法,NCBI经常更新的。
我在NCBI搜了一下。在一些教程里好不容易找到了。
网址: Search for short, nearly exact matches
当然了,现在的界面跟以前的也不大一样了。但用法是差不多的。大同小异嘛。
下面再附一下如何从Blast界面进入到Search for short, nearly exact matches
1,进入Blast(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) ,再点上面的Help
2,点击Blast program seletion guide
3,点击Program Selection Table
4,在Nucleotide一栏找到Search for short, nearly exact matches
不过,现在用Primer-Blast是不一个不错的选择。教程有空翻译一下。
有点相关的文章
- 图文讲解如何用Blast验证引物 (1.000)
- Primer Premier5.0:引物设计软件 (0.867)
- 引物设计的原理与Primer Premier5.0用法 (0.867)
- Primer-BLAST:NCBI的引物设计和特异性检验工具 (0.867)
- Primer3在线引物设计工具 (0.867)
- 隐马尔可夫模型简介 (RANDOM - 0.500)
讲得很详细嘛~~ [强]