Entrez系统扩展组件更有利于检索

Entrez系统增加新特征

在2009年3月4月份的NCBI NEWS 分别有提到了Entrez系统新的一些特征面貌。此次改版后,在文献和序列数据库,栓索的结果增加了一些相关的和可能感兴趣的链接,更加有利于用户的检索,更容易搜到期望的结果。

这些新的扩展组件叫做discovery components,主要有三种类别:Sensors, Database Ads, 和Analysis Tools

Sensors组件在搜索的同时提供一种潜在的更加相关的结果以供选择。对PubMed数据库而言,Citation Sensor是当用户在PubMed数据库搜索文献时显示的;Accession Sensor是用户在PubMed数据库搜索序列数据库相关的数据库显示的,提供在序列数据库的搜索结果;还有一个Hot Topic Sensor,也是在PubMed数据库栓索结果中显示的,例如最近显示是有关H1N1的一些信息。这个是经常改变的,以当前的热门话题为参考。Gene Sensor,精确匹配和显示Gene数据库的结果,开始只在PubMed数据库试用,现在protein 和 nucleotide 数据库一样支持。

Database Ads组件,显示其它数据库的相关信息链接。新的Database Ads,更加强调显示PubMed Central数据库的全文文献。像一些3D结构数据库、流行感病毒的基因组、SARS、HIV等的相关接也出现在检索结果。

Analysis Tools,提供一些相关工具的链接,是非常有用的。像检索序列时直接一键链接到BLAST分析、3D结构分析、蛋白结构域等。

Sensors

上面已经提到,Sensors分为四类:the Citation Sensor, the Accession Sensor, the Hot Topic Sensor, 和 the new Gene Sensor

例如在PubMed数据库搜索“Lander 2001 Nature”,在最顶端的会显示一个Citation Sensor更加精确匹配搜索的关键词。看下图。

Citation Sensor

例如在PubMed数据库搜索基因相关的名称,就会显示Gene Sensor,提供链接到Gene数据库的组件。看下图。

Gene Sensor2

例如在protein数据库搜索某个基因的序列,只要在Gene数据库能匹配上,就会显示Gene Sensor,提供链接到Gene数据库的组件。看下图。

Gene Sensor

例如在PubMed数据库搜索序列Accession,一般在PubMed数据库不一定有,但也显示一个Accession Sensor,链接到GenBank数据库。看下图

Accession Sensor

Database Ads

Hot Topic Sensor和Database Ads如下图所示:

Database Ads2

Analysis Tools

Hot Topic Sensor和Analysis Tools如下图所示:

Analysis Tools

其它

如在序列的显示页面,改变原先的外观,显示其它格式的方法等。还增加了该基因相关的文献和相关的链接。如下图。

Entrez系统扩展组件更有利于检索

 

NCBIEntrez系统,所有这些discovery components的改进,旨在为了给用户提供一个更加完善的检索体验。用户只需动动鼠标,只能找到所有相关的结果。(柳城博客/编译,NCBI News, June 2009)

更多功能,等着你来体验!!

原文检索:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=newsncbi&part=JFKPFT637.bid.1#JFKPFT637.Featured1_1