用Perl下载NCBI的Blast库（Blastdb）

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有时你要构建本地的Blast，需要用到NCBI已经构建好的Blastdb。可以用FTP下载。这里NCBI还提供一个Perl程序来下载NCBI的blast库。

update_blastdb.pl – Download pre-formatted BLAST databases from NCBI。右键另存为

运行

perl update_blastdb.pl

查看各个命令的用法，其中

perl update_blastdb.pl --show

可以查到在NCBI里所有的Blastdb。

perl update_blastdb.pl Blastdb

Blastdb换为需要下载的Blast库的名称。

Blastdb的FTP地址是ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/

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