Uniprot,GO,GenBank,IPI等ID的一一对应

上次讲解了NCBI各种的ID号的一一对应，比方说：accession number、gi、geneid、symbol、go、unigene、pubmed、taxid等等。事实大部分数据库都会有提供一些专门的文件或工具来实现这些数据间大批量的一一对应。

详情请看：如何在NCBI实现大批量数据的一一对应。

现在再提供一下关于Uniprot，GO,GenBank,IPI等ID的一一对应。详细的用法还是看上面。下面只是提供在EBI和GO的FTP地址。

下面是方法：

1，EMBL网站上的。下载一些现成的数据，就可以直接对应到swiss-prot/Uniprot或genbank等。

具体请参考：http://www.ebi.ac.uk/IPI/xrefs.html

ftp地址：ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/IPI/current/

2, GO上的FTP

GO网站，http://www.geneontology.org/GO.indices.shtml

http://www.geneontology.org/external2go/

里面提供了多种数据的一一对应。

3, Uniprot上的数据一一对应

有一个现成的工具，数据量不大的话都可以直接用：http://www.uniprot.org/mapping/

帮助：http://www.uniprot.org/help/mapping

或是用FTP下载到本地来用：ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/idmapping/

~完，没办法全部都讲得清清楚楚。其余的自行解决。