每周精选

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批量开发SSR标记软件:MISA的介绍

MISA工具提供批量识别和定位简单重复序列(SSR),EST序列或是基因组序列都可以。另外,还提供一个与批量设计引物Primer3的接口工具,通过这个工具,可以把MISA识别出来的SSR,转为Primer3需要的格式,从而方便批量设计引物。 阅读更多

entrez

Entrez所有数据库的最新数据统计

Entrez总共有35个数据库,包括 NCBI的站点内容和FTP的内容等。通过all[filter]命令就能查到所有数据库最新的数据记录。常用的数据库有(统计时间:2009/05/04):
Pubmed:        18832968个记录;
Nucleotide: 76750026个记录;
Protein:         26369028个记录;
Gene:              5798947个记录;
UniGene:      3633531个记录; 阅读更多

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ORF Finder使用说明及基因预测

ORF Finder  是一个图形的序列分析工具,分析并找到序列的ORF区(开放读码框架),这个工具使用标准的或其它特殊的遗传密码子列出所有可能的ORF区,并推导出氨基酸序列。

在线网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 阅读更多

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猪流感病毒的序列数据和最新文献

4月27-4月29,短短三天时间,NCBI已经有了78条猪流感病毒序列。速度之快,令人叹服呀。

大部分的序列是由美国疾病控制与预防中心(CDC,The Centers for Disease Control and Prevention )提交,其中有一条是德国雷根斯堡大学(University of Regensburg)在2009/04/29提交的。 阅读更多

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EMBL核酸序列数据库简介及数据统计图

EMBL核苷序列数据库(http:// www.edi.ac.uk/embl/)是欧洲主要的核苷序列收集单位。这个数据库是由欧洲生物信息中心EBI(欧洲分子生物学实验室(EMBL)在德国 Heidelberg 的站点)维护的。 阅读更多

clustalx-20-screenshot-on-mac-os-x

ClustalW、ClustalX介绍及最新版下载地址

         Clustal的基本思想是基于相似序列通常具有进化相关性这一假设。比对过程中,先对所有的序列进行两两比对并计算它们的相似性分数值,然后根据相似性分数值将它们分成若干组,并在每组之间进行比对,计算相似性分数值。 阅读更多

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人类和老鼠基因组测序进展

最后更新时间:2008年6月5号

The Human Genome

Information concerning maintenance and continuing improvement of the human genome. 阅读更多

model-of-entrez-databases

NCBI:Entrez数据库及相互关系模型图

Model of Entrez Databases
模型图显示了Entrez各个数据库及各个数据库之间的相互关系。圆形表示每个数据库,不同的颜色代表了数据库大概的记录数。当鼠标放在圆圈上面时,将会显示与该数据库相关的其它数据库,并指出两个数据库间有多少个链接数存在。
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