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两个在线基因预测工具Glimmer和ORF Finder比较

ORF FinderGlimmer两个都是基因预测的NCBI在线工具:

ORF Finder的主页是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/

Glimmer在线的主页是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/glimmer_3.cgi

关于ORF Finder的详细介绍看:ORF Finder使用说明及基因预测
关于Glimmer的详细介绍看: 微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer 阅读更多

Glimmer的在线运行

微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer

Glimmer简介

Glimmer用于微生物DNA的基因预测,特别是细菌、古细菌、和病毒等的基因组。Glimmer(Gene Locator and Interpolated Markov ModelER)采用内插马尔可夫模型(interpolated Markov models,IMMs)来识别编码区域和从非编码的DNA中区分出来。 阅读更多

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ORF Finder使用说明及基因预测

ORF Finder  是一个图形的序列分析工具,分析并找到序列的ORF区(开放读码框架),这个工具使用标准的或其它特殊的遗传密码子列出所有可能的ORF区,并推导出氨基酸序列。

在线网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 阅读更多