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Primer 3 在线引物设计工具

Primer3在线引物设计工具

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开始之前：其实非常简单，不需要你下载任何软件，但是你得有一台电脑能上网。当然，最重要的是，你要很清楚用于做引物的模板序列，至于怎么找模板序列，不再本次讨论范围。另外，要先对PCR目的序列的长度有个大致估计，好了，马上开始吧：

第一步：找到Primer3的站点。你不用记住这个站点，但是要记住“Primer3”这个词，然后打开GOOGLE首页，输入Primer3，跳出来的第一个项目就是了“Primer3 Input 0.4.0 ”，网址是http://frodo.wi.mit.edu/。 阅读更多 →

primer-blast

Primer-BLAST：NCBI的引物设计和特异性检验工具

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Primer-BLAST介绍

Primer-BLAST，在线设计用于聚合酶链反应（PCR）的特异性寡核苷酸引物。Primer-BLAST可以直接从Blast主页（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/）找到，或是直接用下面的链接进入：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ 阅读更多 →

图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

图文讲解如何用Blast验证引物-补充说明

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介绍:

This search is similar to the standard protein-protein BLAST with the parameters set automatically to optimize for searching with short sequences.

Find primer binding sites or map short contiguous motifs

说明:

上一篇文章:图文讲解如何用Blast验证引物，应该是比较旧了。Blast界面改版后，现在的链接（Search for short, nearly exact matches）已经不在。没办法，NCBI经常更新的。 阅读更多 →

引物是如何合成的及常见问题

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1. 引物是如何合成的？

目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产，无论采用什么机器合成，合成的原理都相同，主要差别在于合成产率的高低，试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。申能博彩公司采用的合成仪主要机型为ABI3900高通量合成仪，合成长链主要采用Beckman 1000M和PE8909 DNA合成仪，引物修饰和高OD数合成采用ABI394等。 阅读更多 →

PCR引物设计知识与技巧分析

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自从1985年Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链式反应(PCP) 以来，PCR已经成为了分子生物学领域最基本也是最重要的技术手段之一。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物，使其有效地扩增模板DNA序列，无疑决定着PCR的成败。现在动物遗传育种早已进入了分子时代，在基因水平寻求影响动物遗传表型的新基因突显重要，因此引物设计无疑又成为了寻找新基因的重中之重。 阅读更多 →

整理:详细介绍引物设计原则

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引物设计原则一：

1. 引物的长度一般为15-30 bp，常用的是18-27 bp，但不应大于38，因为过长会导致其延伸温度大于74℃，不适于Taq DNA聚合酶进行反应。 阅读更多 →

引物（primers)设计一般原则

引物（primers)设计一般原则

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引物（primers)

引物是人工合成的两段寡核苷酸序列，一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补，另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。 阅读更多 →