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如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
我想在NCBI上找猪KIT(FJ938289)基因的结构图以及其内含子和外显子的序列?NCBI提供的Graph…
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Blastp/PSI-BLAST/PHI-BLAST 的详细介绍
PSI-BLAST : 敏感度更高的蛋白序列与蛋白序列之间的比对;PHI-BLAST, 模式发现迭代BLAST…
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BlastN/MegaBlast/Discontiguous MegaBlast 的区别
MEGABLAST : 主要用来鉴定一段新的核酸序列, 速度快。同一物种间的。Discontiguous ME…
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BLAST 核酸/氨基酸序列相似性比较的工具
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA…
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两个在线基因预测工具Glimmer和ORF Finder比较
总的来说,ORF Finder还是好用好多,这是对在线而来的。如果需要对单个序列的基因预测,当然是推荐ORF …
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微生物基因组注释和基因预测工具:Glimmer
Glimmer用于微生物DNA的基因预测,特别是细菌、古细菌、和病毒等的基因组。Glimmer采用内插马尔可夫…
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简并引物的在线设计工具: GeneFisher
GeneFisher提供一个在线的简并引物设计工具,基础是同源基因。目前的版本是2.0,加入了AJAX技术。可…
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如何在NCBI批量下载GenBank序列
GenBank的序列很多,有时我们需要批量下载。这里介绍几种办法,如何从NCBI批量下载GenBank序列。有…