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Citation Sensor

Entrez系统扩展组件更有利于检索

Entrez系统增加新特征

在2009年3月4月份的NCBI NEWS 分别有提到了Entrez系统新的一些特征面貌。此次改版后,在文献和序列数据库,栓索的结果增加了一些相关的和可能感兴趣的链接,更加有利于用户的检索,更容易搜到期望的结果。

这些新的扩展组件叫做discovery components,主要有三种类别:Sensors, Database Ads, 和Analysis Tools

Sensors组件在搜索的同时提供一种潜在的更加相关的结果以供选择。对PubMed数据库而言,Citation Sensor是当用户在PubMed数据库搜索文献时显示的;Accession Sensor是用户在PubMed数据库搜索序列数据库相关的数据库显示的,提供在序列数据库的搜索结果;还有一个Hot Topic Sensor,也是在PubMed数据库栓索结果中显示的,例如最近显示是有关H1N1的一些信息。这个是经常改变的,以当前的热门话题为参考。Gene Sensor,精确匹配和显示Gene数据库的结果,开始只在PubMed数据库试用,现在protein 和 nucleotide 数据库一样支持。 阅读更多

NCBI Entrez系统简介

Entrez是面向生物学家的数据库查询系统,其特点之一是使用十分方便。它把序列、结构、文献、基因组、系统分类等不同类型的数据库有机地结合在一起,通过超文本链接,用户可以从一个数据库直接转入另一个数据库。

NCBI所有数据库
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery 阅读更多

entrez

Entrez所有数据库的最新数据统计

Entrez总共有35个数据库,包括 NCBI的站点内容和FTP的内容等。通过all[filter]命令就能查到所有数据库最新的数据记录。常用的数据库有(统计时间:2009/05/04):
Pubmed:        18832968个记录;
Nucleotide: 76750026个记录;
Protein:         26369028个记录;
Gene:              5798947个记录;
UniGene:      3633531个记录; 阅读更多

中文Entrez序列查询界面

最近经常泡NCBI,头都痛了。不过,还是学到了一些东西的。
看了一些NCBI的PowerScripting,太复杂了,目前只能看懂了一些。也下载了一些教程,无奈头痛呀,好多看不明白。
虽然如此,成果还是有一些的。也不枉这几天的学习。
了解PowerScripting之后,发觉这套系统真是太强大了。不可思议呀。真想马上学会。 阅读更多

model-of-entrez-databases

NCBI:Entrez数据库及相互关系模型图

Model of Entrez Databases
模型图显示了Entrez各个数据库及各个数据库之间的相互关系。圆形表示每个数据库,不同的颜色代表了数据库大概的记录数。当鼠标放在圆圈上面时,将会显示与该数据库相关的其它数据库,并指出两个数据库间有多少个链接数存在。
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