文章

Figure 1: Chromosome 4 record from the GRCh37 primary reference assembly

(译文)NCBI发布版本37的人类基因组序列

原标题:The Genome Reference Consortium Human Genome Build 37 now Available。其中“The Genome Reference Consortium”,找了好久都找不到正确的翻译。按我的理解,可译为基因组参照序列联盟(The Genome Reference Consortium,简称GRC)。

 在2009年8月份,NCBI发布了版本37的人类基因组序列(build 37 of the human genome)。这个版本包含了由GRC提供的新测序的序列和新组装的序列。

 GRC联盟

 GRC联盟是由英国Wellcome Trust Sanger研究中心(the Wellcome Trust Sanger Center)、华盛顿大学基因组中心(The Washington University Genome Center)、欧洲生物信息研究所(the European Bioinformatics Institute)和美国国家生物技术信息中心(NCBI)联合组成。 阅读更多

NCBI新的数据库和工具(NCBI News, June 2009)

BioSystems

BioSystemsNCBI新的数据库,收集合作的公共数据库中所有生物系统的数据。BioSystems是一个集中的生物系统知识库,联合Entrez系统的文献,分子,和化学等的数据。

目前的BioSystems包含有来自KEGG和BioCyc的生物信号通路,未来将会容纳更多其它类型的生物系统数据库。生物系统的明细图和注释在来源的数据库网站可以找到。在NCBI的Gene, HomoloGene, OMIM, 和 Protein Clusters 数据库的记录将会有链接到BioSystems。详情更登陆BioSystems的主页:www.ncbi.nlm.nih.gov/biosystems/ 阅读更多

Citation Sensor

Entrez系统扩展组件更有利于检索

Entrez系统增加新特征

在2009年3月4月份的NCBI NEWS 分别有提到了Entrez系统新的一些特征面貌。此次改版后,在文献和序列数据库,栓索的结果增加了一些相关的和可能感兴趣的链接,更加有利于用户的检索,更容易搜到期望的结果。

这些新的扩展组件叫做discovery components,主要有三种类别:Sensors, Database Ads, 和Analysis Tools

Sensors组件在搜索的同时提供一种潜在的更加相关的结果以供选择。对PubMed数据库而言,Citation Sensor是当用户在PubMed数据库搜索文献时显示的;Accession Sensor是用户在PubMed数据库搜索序列数据库相关的数据库显示的,提供在序列数据库的搜索结果;还有一个Hot Topic Sensor,也是在PubMed数据库栓索结果中显示的,例如最近显示是有关H1N1的一些信息。这个是经常改变的,以当前的热门话题为参考。Gene Sensor,精确匹配和显示Gene数据库的结果,开始只在PubMed数据库试用,现在protein 和 nucleotide 数据库一样支持。 阅读更多

NCBI新的数据库和工具(2009年05月)

NCBI News, May 2009

H1N1流感资源

流感病毒最新数据和序列的页面:www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/SwineFlu.html
PubMed里关于流感的最新文献:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=swine+AND+(flu+OR+influenza+OR+h1n1)+AND+%22last+1+year%22%5bedat%5d 阅读更多

精选资料:2009 H1N1流感病毒序列

精选资料:2009 H1N1流感病毒序列

柳城博客:本文翻译自NCBI News, May 2009)2009年全球H1N1流感突然爆发,NCBI作为流感病毒序列的储存库,一直为加快序列的发布作出最大的努力。现在,你可以取到最新的H1N1流感病毒的序列,并且在一个专门为H1N1流感病毒设计的页面中找到最新的信息。 阅读更多