Bioperl:使用和解析 BLAST 2009年04月28日/6 评论/在: Biocompute /通过: 柳城转自:Perlchina.org 使用和解析 BLAST 在生物信息学中最流行的数据库搜索程序就是 BLAST 了,和前面获取序列数据的原则一样,也有两种方法可以让你使用BLAST:在 NCBI 等站点上运行它并得到返回结果,或者下载到本地运行。 阅读更多 → http://liucheng.name/logo.gif 0 0 柳城 http://liucheng.name/logo.gif 柳城2009-04-28 12:51:562009-08-13 13:52:58Bioperl:使用和解析 BLAST
Bioperl:获取序列数据 2009年04月27日/1 评论/在: Biocompute /通过: 柳城转自:PerlChina.org 有两种方法: 1, 使用 Bio::DB::GenBank (使用Web Interface获取序列数据,当需要获取大量数据的时候不建议使用,否则 ip 有可能被 ban) 2, 下载整个 NCBI 数据库到本地,使用 Bio::DB::Flat 对它建立 index。 阅读更多 → http://liucheng.name/logo.gif 0 0 柳城 http://liucheng.name/logo.gif 柳城2009-04-27 15:12:152009-12-24 14:17:49Bioperl:获取序列数据