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如何用COBALT构建本地的多序列比对(Linux系统)
COBALT是一个蛋白的多序列比对工具,也用到RPS-BLAST, BLASTP, 和PHI-BLAST等工具…
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COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对(比ClustalW还强大的工具)
COBALT是一个蛋白的多序列比对工具,其实用法跟ClustalW是很像的。算法应该是不一样的。在我看来,CO…
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ClustalX做多序列比对分析图示
1、打开程序;2、Load Sequnce, 载入序列;3、选择序列文件,FASTA格式的;4、用文本编辑器察…
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多序列比对及蛋白质功能及结构预测(5)
根据序列或多序列列线预测蛋白质二级结构的技术已相对比较成熟,但三级结构的预测则相当困难。往往对于三级结构预测,…
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多序列比对及蛋白质功能及结构预测(4)
如果序列重叠群(contig)包含有蛋白质编码区,则接下来的分析任务是确定表达产物–蛋白质的功能。
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多序列比对及蛋白质功能及结构预测(3)
多序列比对的意义在于它能够把不同种属的相关序列的比对结果按照特定的格式输出,并且在一定程度上反映它们之间的相似…
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多序列比对及蛋白质功能及结构预测(2)
这类方法中最常用的就是Clustal,它是由Feng和Doolittle于1987年提出的(Feng和Dool…
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多序列比对及蛋白质功能及结构预测(1)
双序列比对是序列分析的基础。多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着相当重要的作用。